1.ダウンロード＆インストール
http://www.graphviz.org/から。
「C:\Program Files (x86)\doxygen」にインストールしたみた。

2.Doxygenの設定
doxywizardを使う場合はExpertタブ内でDotに関する項目を変更するだけです。
最低限「HAVE_DOT」にチェックを入れ、「DOT_PATH」にdot.exeの存在するディレクトリを指定すれば動作します。

3.備考
Doxygen単体での使用と違いgraphvizは画像を生成するので多少時間がかかります。
GRAPHICAL_HIERARCHYのチェックが入っていなければ2回目以降は早くなると思います。